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浮游细菌采样器作为一种精密仪器，为保证检测的精准程度。需要对这种采样器进行校验。一般在校验的时候主要调整2种因素。也就是对目标采样时间以及流量来调整。这样能从而满足目标总采样体积的需要。
像是对调节目标采样流量的话，是可以满足安德森撞击需求的。这也能保证采样器的平稳工作。但是有些国产浮游细菌采样器的这个因素是使用默认值，使用人是不能调节的。当检测是只能在这基础上去改变采样的时间。然后实现具体的要求。

在平时的计量检测中，不仅浮游细菌采样器要能运行是流量，如果出现流量的误差超出规定的要求，还是需要去流量校准。校验的时候，使用人可以把实测流量值输进仪器。然后去改变采样的时间，就算是实际流量要比需要的流量差距大，也是能让采样总体上是正确的。
除此以外，使用浮游细菌采样器的时候，也可以调节风机的功率实现校验。这样可以实现对采样流量的调节控制。当然这种校验方式可以通过硬件或者软件的方式来改变。